fa ارزیابی بیوانفورماتیک ترکیبات فعال گیاه شنبلیله در سرکوب آنزیم آلفاگلوکوزیداز تخصصي Special پژوهشي Research <strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">مقدمه:</span></span></strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> دیابت یک سندرم متابولیکی است که با افزایش قند خون مشخص می‌شود. آنزیم‌های آلفاگلوگوزیداز که در میان پرزهای روده کوچک قرار دارند مسؤول هیدرولیز کربوهیدرات‌ها هستند. هدف این تحقیق</span></span> <span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">ارزیابی بیوانفورماتیک ترکیبات فعال گیاه شنبلیله در سرکوب آنزیم آلفاگلوکوزیداز است. </span></span><br> <strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">روش‌ها:</span></span></strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> این پژوهش به روش توصیفی- تحلیلی صورت گرفت. بدین منظور، ابتدا مهم‌ترین ترکیبات جداشده‌ی شنبلیله از پایگاه داده‌ای </span></span><span dir="LTR">PubChem</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> دانلود شدند و سپس فایل مربوط به آنزیم آلفاگلوکوزیداز از پایگاه </span></span><span dir="LTR">PDB</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> دریافت شد. کلاس سمیت ترکیبات و قوانین لیپینسکی ترتیب توسط </span></span><span dir="LTR">Toxtree & Protox II</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> و سرور </span></span><span dir="LTR">Swiss ADME</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> پیش‌بینی شدند. در پایان، داکینگ مولکولی و برهم‌کنش آنزیم‌ با ترکیبات موجود در شنبلیله توسط </span></span><span dir="LTR">AutoDock Tools 1.5.6</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> و </span></span><span dir="LTR">Molegro Virtual Docker 6.0</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> صورت گرفت. هم‌چنین آنالیز نتایج مربوط به اینتراکشن‌ها با دو نرم‌افزار </span></span><span dir="LTR">Discovery Studio 3.5</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> و </span></span><span dir="LTR">Ligplot 2.1</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> صورت گرفت.</span></span><br> <strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">یافته‌ها:</span></span></strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> نتایج مشخص کرد که همه ترکیبات انتخاب شده در شنبلیله با پیروی از قانون لیپینسکی، انرژی اتصال مناسب و نداشتن سمیت گزینه‌های مناسبی در مهار آنزیم آلفاگلوکوزیداز هستند. اما از میان این ترکیبات، ترکیب </span></span><span dir="LTR">Vitexin</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> با 8/4- کیلوکالری بر مول کم‌ترین انرژی اتصال و بیش‌ترین اثر مهاری را بر آنزیم آلفاگلوکوزیداز داشت. این ترکیب هم‌چنین انرژی اتصال منفی‌تری نسبت به مهارکننده استاندارد (ووگلیبوز) داشتند. </span></span><br> <strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">نتیجه‌گیری:</span></span></strong><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> از نتایج این پژوهش می‌توان نتیجه گرفت که از میان مهم‌ترین ترکیبات موجود در شنبلیله، ترکیب </span></span><span dir="LTR">Vitexin</span><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> به‌دلیل ایجاد برهم‌کنش هیدروژنی و هیدروفوبی بیش‌تر با آمینواسیدهای جایگاه فعال آنزیم آلفاگلوکوزیداز، مهارکننده قوی‌تری محسوب می‌شود. </span></span><br> &nbsp; <strong>Background: </strong>Diabetes mellitus is a metabolic syndrome characterized by elevated blood glucose. The &alpha;-glucosidase enzymes that are found in the small intestine are responsible for the hydrolysis of carbohydrates. The aim of this study was to Bioinformatics evaluation of <em>T.foenum</em> active compounds in suppression of &alpha;-glucosidase enzyme<span dir="RTL">.</span><strong><span dir="RTL"></span></strong><br> <strong>Methods: </strong>This study was a descriptive-analytical method. For this purpose, the compounds separation of <em>Trigonella foenum</em> were first downloaded from PubChem database and then the &alpha;-glucosidase enzyme file was obtained from PDB database. The toxicity class of compounds and the Lipinski rules were predicted by Toxtree & Protox II and the Swiss ADME server, respectively. Finally, molecular docking and enzyme interaction with the compounds in <em>Trigonella foenum</em>were performed by AutoDock Tools 1.5.6 and Molegro Virtual Docker 6.0. Interaction results were also analyzed using Discovery Studio 3.5 & Ligplot 2.1 software.<br> <strong>Results: </strong>The results indicated that all selected of compounds in <em>Trigonella foenum</em>were in follow with Lipinski&#39;s rules, proper binding energy, and lack of toxicity were appropriate options for &alpha;-glucosidase inhibition. But among these compounds, Vitexin had the lowest binding energy and the most inhibitory effect on the &alpha;-glucosidase enzyme, with -4.8 kcal/mol. These compounds also had lower binding energy than standard inhibitor (Voglibose).<br> <strong>Conclusion: </strong>From the results of this study, it can be concluded that among the most important compounds in <em>Trigonella foenum</em>, the Vitexin compound power inhibitor that due to more hydrogen and hydrophobic interactions with the &alpha;-glucosidase enzyme active site.<br> &nbsp; آلفاگلوکوزیداز, شنبلیله, داکینگ مولکولی, انرژی اتصال Αlpha-Glucosidase, Trigonella foenum, Binding energy, Molecular docking 200 209 http://ijdld.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1507-1&slc_lang=fa&sid=1 Morteza Sadeghi مرتضی صادقی mo.sadeghi@sci.ui.ac.ir Yes Department of Cell and Molecular Biology & Microbiology, University of Isfahan, Isfahan, Iran گروه زیست‌شناسی سلولی مولکولی و میکروبیولوژی Mehran Miroliaei مهران میراولیایی No Department of Cell and Molecular Biology & Microbiology, University of Isfahan, Isfahan, Iran گروه زیست‌شناسی سلولی مولکولی و میکروبیولوژی